摘 要:目的:探讨中国苏州地区汉族人群MCP-1-2518 A/G,IL-8-251 A/T基因多态性的基因型分布及种族差异性。方法:采用PCR-RFLP和DNA测序的方法检测中国苏州汉族120例健康人群的MCP-1-2518 A/G,IL-8-251 A/T位点基因型分布及等位基因频率,并分析与国内外其他地区及种族间的差异。结果:苏州地区汉族人群中MCP-1-2518位点基因型分布与德国、美国、西班牙、韩国健康人群比较,差异均有统计学意义(P<0.01),苏州与台湾及湖南省相比较,及德国、美国和西班牙之间比较,差异无统计学意义(P>0.05)。苏州地区IL-8-251 A/T位点基因型分布与丹麦、德国、西班牙、日本等健康人群比较,差异有统计学意义(P<0.01),但与福建籍和广东籍台湾人及北京市健康人群比较,差异无统计学意义(P>0.05)。结论:中国苏州地区汉族人群MCP-1-2518 A/G及IL-8-251 A/T位点基因型分布与基因频率与其他地区种族人群比较,差异有统计学意义(P<0.05)。
关键词:MCP-1基因;IL-8基因;基因多态性
单核细胞趋化因子(MCP-1)和白细胞介素-8(IL-8)是趋化因子超家族的成员。本研究应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)和DNA测序的方法对苏州地区汉族人群中MCP-1-2518 A/G,IL-8-251 A/T基因多态性,初步确定其在苏州地区汉族人群中的分布,并通过与其他种族和地区相比较了解可能存在的种族和地域性差异。 1 资料与方法 1.1 一般资料:选择门诊健康体检人员120例,男71例,女49例,平均年龄(51.05±9.37)岁。所有入组人员均为无血缘关系的中国汉族苏州人。 1.2 方法 1.2.1 DNA的提取:取研究对象外周静脉血3 ml(EDTA抗凝),应用Wizard DNA抽取试剂盒,按照说明书操作提取全基因组DNA,基因组DNA储存在-20℃为成批处理。 1.2.2 MCP-1-2518基因多态性应用RFLP-PCR技术分析:上游引物:5’-CCAGAGTGTTCCCAGCACAG-3’,下游引物:5’-CTGCTTTGCTTGTGCCTCTT-3’。PCR反应体系(50 μl)包含10 μg DNA模板,dNTPs 1 μl,上下游引物各2 μl,Taq酶 0.5 μl,缓冲液 5 μl,双蒸水33 μl。反应条件为:95℃预变性5 min,95℃ 40 s、 57℃ 40 s、72℃ 60 s 30个循环,72℃延伸10 min。限制内切酶酶切PCR产物:应用限制内切酶PvuⅡ对PCR扩增产物在37℃下进行酶切16 h,反应体系20 μl:PCR产物10 μl,PvuⅡ 2 μl,缓冲液2 μl,双蒸水16 μl。酶切产物在2%琼脂糖凝胶上进行电泳,以溴化乙锭染色。 1.2.3 IL-8-251基因多态性应用DNA测序技术分析:上下游引物:5' ATTGGCTGGCTTATCTTC 3'和5' TTCCTGGCTCTTGTCCTA 3',反应条件为:94℃预变性5 min,94℃ 30 s、52℃ 60 s、72℃ 45 s 35个循环,72℃延伸5 min。产物长度485 bp。PCR产物在ABI 377自动测序仪上检测。 1.2.4 统计学处理:应用χ2检验和精确概率法比较基因型频率差异,以P<0.05为差异有统计学意义。采用SPSS 13.0统计软件处理。基因型分布频率经Hardy-Weinberg Equilibrium检验群体代表性。 2 结果 苏州地区汉族人群中MCP-1基因-2518 A/G位点的PCR扩增产物片段为930 bp,酶切扩增产物显示930 bp一条带为AA型,显示708和222 bp二条带为GG型,显示930、708和222 bp三条带为AG型。苏州地区汉族人群中IL-8-251 A/T位点DNA测序分析结果AA、AT、TT三种基因型。 中国苏州地区汉族人群MCP-1-2518A/G和IL-8-251 A/T多态性基因型分布及等位基因频率男女之间比较,差异无统计学意义(P>0.05)。各位点的基因型均符合Hardy-Weinberg遗传平衡规