摘 要:目的:探讨16SrRNA在医学微生物鉴定中的应用。方法:利用16SrRNA序列对肠道的双歧杆菌、乳酸杆菌、大肠杆菌和肠球菌定量测定以了解16SrRNA在医学微生物鉴定中的应用。结果:双歧杆菌、乳酸杆菌数量减少,有害菌大肠杆菌和肠球菌增加。结论:16SrRNA在微生物分类的鉴定已经得到广泛的认识和应用。
关键词:16SrRNA;微生物鉴定;细菌种属
随着分子生物学的发展以及各项新技术的临床广泛应用,细菌微生物的分类鉴定从鉴定表型特征,深化为基因特征的分类,在技术提高到细胞分子的水平[1]。16SrRNA、23SrRNA、16-23SrRNA间隔区、RNA聚合酶的β亚基、超氧化物歧化酶、DNA促旋酶B基因等是遗传学的候选基因,应用最多的是16SrRNA基因。分子标记法包括RAPD(随机扩增多态性DNA),AFLP(扩增片段长度多态性),REP-PCR(重复基因外回文序列)。细菌体内基本存在三种核糖体RNA,即16SrRNA和23 rRNA、5 rRNA,参与细菌的蛋白质的合成过程。其中16SrRNA比真核生物的相应rRNA略小,16SrRNA及其基因在微生物鉴定中有重要作用,由于细菌各种属间生理特征和生化特征相似,单凭传统方法已无法准确的进行分类鉴定,随着科技的发展,现在已经能通过对细菌DNA,最常用的是16SrRNA基因的进行鉴定区分细菌种属[2]。 1 资料与方法 1.1 一般资料:选择洁净级小鼠20只,体重接近,10只空腹20 h腹腔注射STZ,72 h后加强注射,以血糖值>11 mmol/L为标准作为样品组,10只作为对照组,以无菌方式采取新鲜粪便,进行DNA提取。根据长双歧杆菌、大肠杆菌、嗜酸乳杆菌和肠球菌16SrDNA基因序列,设计相应菌属的引物。并对比PCR引物序列的相应菌属特异性。将提取的DNA样品以PCR产物制备的标准曲线进行分析。 1.2 统计学方法:PCR仪用系统内置软件处理后的定量结果。 2 结果 两组细菌定量(拷贝数/克湿粪)比较:见表1。 表1 细菌定量() 组别双歧杆菌乳酸杆菌大肠杆菌肠球菌对照组9.47±0.218.42±1.159.58±1.297.47±0.83样品组8.42±0.697.54±1.1210.42±1.017.95±0.69 样品组有益菌双歧杆菌、乳酸杆菌数量相对于对照组减少,有害菌大肠杆菌和肠球菌数量相对于对照组增加。 3 讨论 对微生物的鉴定,细菌培养虽然广泛用于对病原菌的检测,但存在所需时间长、敏感度低等缺点,采用传统的方法对微生物进行分离与鉴定,需要获得的培养物纯度较高,但是获得的纯培养的微生物比例很少,大量的微生物无法得到培养和鉴定[3]。16SrRNA相对应的16SrDNA序列,集保守性与变异性于一身,存在于细菌染色体基因组中,不存在于病毒、真菌等非原核生物体内。16SrDNA具有以下特点:①多拷贝:使得该编码基因的分子生物学检测灵敏度较高;②多信息:由于所有细菌共有保守区,细菌之间没有差别,所以可以通过保守区设计通用引物,而可变区具有特异性,可以用来进行细菌鉴定;③长度适中:其
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